Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms