Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms