Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptpn4Q9WU22 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptpn4Q9WU22 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ptpn4Q9WU22 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ptpn4Q9WU22 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ptpn4Q9WU22 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ptpn4Q9WU22 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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