Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms