Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Crlf1Q9JM58 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Crlf1Q9JM58 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Crlf1Q9JM58 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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