Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms