Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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