Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmod3Q9JHJ0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmod3Q9JHJ0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod3Q9JHJ0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod3Q9JHJ0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmod3Q9JHJ0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmod3Q9JHJ0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod3Q9JHJ0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod3Q9JHJ0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod3Q9JHJ0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod3Q9JHJ0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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