Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp6Q9ESX2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sp6Q9ESX2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms