Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms