Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms