Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tmigd1Q9D7L8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tmigd1Q9D7L8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmigd1Q9D7L8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms