Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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