Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TbcbQ9D1E6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TbcbQ9D1E6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TbcbQ9D1E6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TbcbQ9D1E6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms