Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms