Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CactinQ9CS00 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms