Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Mrpl35Q9CQL6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Mrpl35Q9CQL6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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