Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms