Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms