Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms