Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nup155Q99P88 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms