Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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