Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms