Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms