Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SmagpQ99KC7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms