Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms