Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps3Q91VB4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms