Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms