Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc8Q8VD72 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc8Q8VD72 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms