Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms