Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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