Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms