Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q4Q8HWB2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q4Q8HWB2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms