Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms