Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Nhlrc3Q8CCH2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Nhlrc3Q8CCH2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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