Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms