Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms