Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms