Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrsam1Q80ZI6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrsam1Q80ZI6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrsam1Q80ZI6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms