Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NanogQ80Z64 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NanogQ80Z64 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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