Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pcsk9Q80W65 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Pcsk9Q80W65 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pcsk9Q80W65 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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