Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms