Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clec4b1Q7TS58 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clec4b1Q7TS58 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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