Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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