Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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