Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Irf4Q64287 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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