Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Foxd1Q61345 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms