Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms