Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms