Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms